1. Data storage

一张图的数据包含两个部分：network data与attribute data。

• Attribute data很简单：每列是attribute（第一列往往是node ID），每行是一个node的信息。
• Network data则有三种常用的formats：Adjacency matrix & Edgelist & Nodelist.

1.1 Adjacency matrix format

• 第一行和第一列都是node label。
  • 如果是directed network，sender是rows，receiver是columns。
• 适用于one-mode数据，也适用于two-mode数据。
• 该format file的checklist：

1.2 Edge-list format

• 有向图：第一列是sender，第二列是receiver。
• 无向图：节点i和节点j之间的边，只用输入一次即可。
• 第三列「可选(不必需)」，表示strength of the tie。
• 若是two-mode graph，第一列是一个mode，第二列是另一个mode。
• 对于isolates的处理：可以在该文件中加上一个自己指向自己的strength为0的行，也可以在R中import data的时候加上。
• 该format file的checklist：

1.3 Node-list format

• 每个node为一行。